Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms