Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms