Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms