Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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