Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NECTIN1Q15223 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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