Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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