Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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