Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HNF4GQ14541 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HNF4GQ14541 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms