Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms