Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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