Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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