Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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