Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EIF4EBP1Q13541 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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