Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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