Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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