Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TRAF2Q12933 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TRAF2Q12933 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TRAF2Q12933 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TRAF2Q12933 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TRAF2Q12933 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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