Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms