Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms