Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms