Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms