Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms