Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLCB3Q01970 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms