Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms