Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms