Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCBP3P57721 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCBP3P57721 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms