Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME5P56597 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME5P56597 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME5P56597 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms