Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH15P55291 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH15P55291 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms