Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms