Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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