Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms