Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms