Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MLH1P40692 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MLH1P40692 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MLH1P40692 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MLH1P40692 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MLH1P40692 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms