Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms