Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms