Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPDP35247 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPDP35247 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms