Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms