Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms