Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK11BP21127 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms