Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFE3P19532 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFE3P19532 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFE3P19532 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFE3P19532 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms