Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTLA4P16410 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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