Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAV1P15498 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAV1P15498 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAV1P15498 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAV1P15498 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms