Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BMP3P12645 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMP3P12645 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms