Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC172P0C7W6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms