Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms