Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E9PBE3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E9PBE3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E9PBE3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms