Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms