Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PALM3A6NDB9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms