Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms