Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00588Q9Y4M8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms