Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKP3Q9Y446 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms